Regulación transcripcional de genes cloroplásticos
El laboratorio de Biología Computacional y Estructural de la Estación Experimental de Aula Dei (EEAD-CSIC) tiene experiencia en el desarrollo de herramientas bioinformáticas para el estudio de las redes de regulación transcripcional [1,2] y ha contribuido recientemente al análisis de los genomas cloroplásticos [3]. Este proyecto de introducción a la investigación tiene dos objetivos:
1) Sentar las bases para un análisis evolutivo de las huellas filogenéticas de regulación transcripcional en el cloroplasto, teniendo en cuenta que hay ya disponibles más de 200 genomas plastídicos en las bases de datos públicas. Este estudio pretende identificar secuencias reguladoras en los promotores de genes cloroplásticos ya sean codificados en el propio cloroplasto o en el genoma nuclear, con el fin de ampliar nuestro conocimiento de la regulación de este orgánulo esencial para la viabilidad de las plantas [4,5].
2) El aprendizaje por parte del estudiante de herramientas bioinformáticas para el análisis funcional de genomas. A lo largo de la estancia la persona seleccionada se familiarizará con el trabajo cotidiano de la investigación en Bioinformática en el campo de la genómica. Esperamos que los alumnos interesados en este proyecto tengan sólidos conocimientos en Biología Molecular y/o Bioquímica y se valorará especialmente experiencia previa o interés en programar y aplicar herramientas bioinformáticas.
Investigador:
Contreras Moreira (on leave since 30/09/2018) , Bruno
Regulación transcripcional de genes cloroplásticos
El laboratorio de Biología Computacional y Estructural de la Estación Experimental de Aula Dei (EEAD-CSIC) tiene experiencia en el desarrollo de herramientas bioinformáticas para el estudio de las redes de regulación transcripcional [1,2] y ha contribuido recientemente al análisis de los genomas cloroplásticos [3]. Este proyecto de introducción a la investigación tiene dos objetivos:
1) Sentar las bases para un análisis evolutivo de las huellas filogenéticas de regulación transcripcional en el cloroplasto, teniendo en cuenta que hay ya disponibles más de 200 genomas plastídicos en las bases de datos públicas. Este estudio pretende identificar secuencias reguladoras en los promotores de genes cloroplásticos ya sean codificados en el propio cloroplasto o en el genoma nuclear, con el fin de ampliar nuestro conocimiento de la regulación de este orgánulo esencial para la viabilidad de las plantas [4,5].
2) El aprendizaje por parte del estudiante de herramientas bioinformáticas para el análisis funcional de genomas. A lo largo de la estancia la persona seleccionada se familiarizará con el trabajo cotidiano de la investigación en Bioinformática en el campo de la genómica. Esperamos que los alumnos interesados en este proyecto tengan sólidos conocimientos en Biología Molecular y/o Bioquímica y se valorará especialmente experiencia previa o interés en programar y aplicar herramientas bioinformáticas.